In Malawi sind um 180 Säugetiere nachgewiesen, darunter viele Fledermäuse und kleine Nager. Interessanter für „normale“ Naturreisende sind die zahlreichen Antilopen, wie Elen, Großkudu, Ellipsen-Wasserbock, Rappen- und Pferdeantilope. Von den Primaten bekommt man häufig den Steppenpavian zu Gesicht. Elefanten sind die Stars im Liwonde National Park. Dort sind auch Flusspferde häufig, für Nashörner und Löwen laufen Wiederansiedlungsprogramme. Große Beutegreifer sind rar, bei Nachtexkursionen sieht man ab und an Hyänen, Schakale und kleinere Prädatoren wie Mungos, Zibet- und Ginsterkatzen.
Die ca. 650 teilweise sehr seltenen Vogelarten locken viele Ornithologen nach Malawi.
Spektakulär ist die Artenanzahl der Fische. Immerhin sind ca. 500 Spezies bekannt, von den ca. 90 % nur in Malawi vorkommen. Aquarianern sind die Buntbarsche aus den Malawisee wohl bekannt.